भंगुर परितंत्र जैसे मैंग्रोव और नम भूमि
हिमालय में अगम्य आवास (हैबिटैट)
प्राकृतिक आवासों और वनस्पति का विनाश तथा झूम खेती
आरक्षित जीवमंडल बनाना
जलवायु परिवर्तन, औद्योगिक विकास एवं प्राकृतिक आवासों में कमी के चलते जैव विविधता के समक्ष बड़ा खतरा उत्पन्न हो गया है। देश के पूर्वी और उत्तर-पूर्वी हिस्सों में झूम खेती प्रचलित है, जो कि खेती का अवैज्ञानिक तरीका है। झूम खेती के फलस्वरूप बड़े पैमाने पर वनों का नाश हुआ है और भूमि की उर्वरा शक्ति कम हुई है।
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